Premye a tout, anvan ou chwazi egzèsis la, gade asye pur labride asyeKi difikilte pwosesis la? Chèche konnen difikilte a, li ka trè egzak, trè rapid pou jwenn itilizasyon yon ti bout egzèsis. Ki difikilte ki genyen nanbride asye purPwosesis? Kouto kout: chip asye pur pou pwosesis la solid e di, tanperati koupe a wo anpil. Lè chip la ap koule fò nan sifas devan kouto a, sa ap afekte lyezon, soude fizyon ak lòt fenomèn kole, sa ap afekte klète sifas pati pwosesis yo; travay di a grav.

Nan konsomasyon an nangwo bride, gen anpil faktè ki afekte fonksyongwo bride, sa nou pral di kèk faktè komen, premye a se tanperati rekwi a (tanperati rekwi a se paramèt tanperati primè a ak modèl la respektivman, lè 50 pousan nan sekans primè a ak konplemantè a se tanperati molekil ADN doub-brin yo.
Li se yon faktè ki pi enpòtan ki afekte ESPESIFIKITE PCR a. Nan ka anbisyon, tanperati rekwi a ba ase pou asire ke amorseur a itil pou etenn ak sekans sib la, epi wo ase ansanm pou diminye non-espesifikite a, respektivman. Tanperati rekwi rezonab ant 55 ak 70 jeneralman fikse pou 5 pi ba pase Tm amorseur a.